Objetivo: Identificar la tendencia de la mortalidad nacional por diabetes según el nivel de marginalidad estatal y municipal. Método: Se realizó un estudio descriptivo con los registros de defunciones por diabetes en mayores de 20 años entre los años 1990 y 2013. Se calculó la tasa de mortalidad nacional estandarizada por edad según la población mundial del año 2000 y para el ámbito estatal se consideró la población nacional proyectada al año 2013. Se realizó un análisis joinpoint para análisis de tendencia. Resultados: Para la población general, el porcentaje de cambio anual entre 1990 y 1996 fue de 2.2, de 1996 a 2005 fue de 4.3 y de 2005 a 2013 fue de 0.1. El mayor incremento entre las mujeres ocurrió entre 1998 y 2005, mientras que entre los hombres ocurrió entre 1995 a 2006. En el ámbito estatal se encontró un mayor porcentaje de cambio anual entre las localidades con mayor grado de marginación. Conclusiones: La mortalidad por diabetes en las mujeres muestra una disminución importante desde el año 2004; entre los hombres, la mortalidad continúa con una tendencia al alza, lo cual concuerda con la tendencia que la enfermedad ha tenido en los últimos años